中醫藥被積極用於調控腸腦軸，以治療肥胖和相關代謝疾病，其機制多圍繞調控菌群、增強代謝和抗炎作用展開，例如像陳皮這一類藥材，於胃腸道系統研究中，顯示出抗能肥胖的可能性 ; 中醫非藥物療法也顯示出對代謝失衡的益處，最直接的是有規律運動，被認為是「行氣活血」最好的良方，能加強腸胃蠕動、促進營養吸收，並刺激大腦分泌血清素，穩定情緒。